Con la finalidad de hacer más eficiente la operación de carga que se mueve a través del ferrocarril, y a la vez, atender la relación que hay entre puerto-ciudad, la Administración Portuaria Integral (API) de Manzanillo, en coordinación con el Centro SCT, la Aduana, Ferromex y las terminales portuarias reprogramaron las ventanas de entrada y salida del tren al Puerto Interior.
De acuerdo con el comunicado de la API, que encabeza el contraalmirante Alejandro Miranda Oceguera, los horarios de las ventanas de ingreso y egreso al Puerto serán de lunes a viernes desde las 22:00 horas hasta las 07:00 horas del día siguiente y cruzará por la ciudad a las 11:00 horas; los sábados, el recorrido de la máquina se estableció de 11:00 horas a 12:00 horas y el cruce por la tarde iniciará desde las 18:00 horas hasta las 20:00 horas.
Estos tiempos no tienen fecha de término, por lo tanto para los domingos se estableció que el ferrocarril cruzará en dos ocasiones: la primera será de 09:00 a 10:00 horas; y la segunda vez se iniciará a partir de las 18:00 horas para finalizar a las 20:00 horas.
